Protein–RNA interactions for Protein: A6NGN4

PRAMEF25, PRAME family member 25, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF25A6NGN4 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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PRAMEF25A6NGN4 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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PRAMEF25A6NGN4 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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