Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 SMAD9-IT1-201ENST00000437983 504 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 Z99916.3-201ENST00000623422 1080 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 AC023090.1-201ENST00000592906 502 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSDA5PKW4 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms