Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNF0

PACSIN2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN2Q9UNF0 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PACSIN2Q9UNF0 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PACSIN2Q9UNF0 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PACSIN2Q9UNF0 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PACSIN2Q9UNF0 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PACSIN2Q9UNF0 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PACSIN2Q9UNF0 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PACSIN2Q9UNF0 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PACSIN2Q9UNF0 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PACSIN2Q9UNF0 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PACSIN2Q9UNF0 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PACSIN2Q9UNF0 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PACSIN2Q9UNF0 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PACSIN2Q9UNF0 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PACSIN2Q9UNF0 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PACSIN2Q9UNF0 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PACSIN2Q9UNF0 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PACSIN2Q9UNF0 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PACSIN2Q9UNF0 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PACSIN2Q9UNF0 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PACSIN2Q9UNF0 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PACSIN2Q9UNF0 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PACSIN2Q9UNF0 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PACSIN2Q9UNF0 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PACSIN2Q9UNF0 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PACSIN2Q9UNF0 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PACSIN2Q9UNF0 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PACSIN2Q9UNF0 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PACSIN2Q9UNF0 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PACSIN2Q9UNF0 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PACSIN2Q9UNF0 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PACSIN2Q9UNF0 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PACSIN2Q9UNF0 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PACSIN2Q9UNF0 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PACSIN2Q9UNF0 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PACSIN2Q9UNF0 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PACSIN2Q9UNF0 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PACSIN2Q9UNF0 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PACSIN2Q9UNF0 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PACSIN2Q9UNF0 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PACSIN2Q9UNF0 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PACSIN2Q9UNF0 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PACSIN2Q9UNF0 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PACSIN2Q9UNF0 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PACSIN2Q9UNF0 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PACSIN2Q9UNF0 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PACSIN2Q9UNF0 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PACSIN2Q9UNF0 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PACSIN2Q9UNF0 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PACSIN2Q9UNF0 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PACSIN2Q9UNF0 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PACSIN2Q9UNF0 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PACSIN2Q9UNF0 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PACSIN2Q9UNF0 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PACSIN2Q9UNF0 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PACSIN2Q9UNF0 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PACSIN2Q9UNF0 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PACSIN2Q9UNF0 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PACSIN2Q9UNF0 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PACSIN2Q9UNF0 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PACSIN2Q9UNF0 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PACSIN2Q9UNF0 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PACSIN2Q9UNF0 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PACSIN2Q9UNF0 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PACSIN2Q9UNF0 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PACSIN2Q9UNF0 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PACSIN2Q9UNF0 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PACSIN2Q9UNF0 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PACSIN2Q9UNF0 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PACSIN2Q9UNF0 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PACSIN2Q9UNF0 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PACSIN2Q9UNF0 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PACSIN2Q9UNF0 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PACSIN2Q9UNF0 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PACSIN2Q9UNF0 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PACSIN2Q9UNF0 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PACSIN2Q9UNF0 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PACSIN2Q9UNF0 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PACSIN2Q9UNF0 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PACSIN2Q9UNF0 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PACSIN2Q9UNF0 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PACSIN2Q9UNF0 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PACSIN2Q9UNF0 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PACSIN2Q9UNF0 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PACSIN2Q9UNF0 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PACSIN2Q9UNF0 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PACSIN2Q9UNF0 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PACSIN2Q9UNF0 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PACSIN2Q9UNF0 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PACSIN2Q9UNF0 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PACSIN2Q9UNF0 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PACSIN2Q9UNF0 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PACSIN2Q9UNF0 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PACSIN2Q9UNF0 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PACSIN2Q9UNF0 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PACSIN2Q9UNF0 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PACSIN2Q9UNF0 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PACSIN2Q9UNF0 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PACSIN2Q9UNF0 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PACSIN2Q9UNF0 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms