Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB5

CDH7, Cadherin-7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH7Q9ULB5 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH7Q9ULB5 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH7Q9ULB5 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH7Q9ULB5 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH7Q9ULB5 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH7Q9ULB5 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH7Q9ULB5 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH7Q9ULB5 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH7Q9ULB5 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH7Q9ULB5 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH7Q9ULB5 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH7Q9ULB5 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH7Q9ULB5 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH7Q9ULB5 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH7Q9ULB5 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH7Q9ULB5 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDH7Q9ULB5 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDH7Q9ULB5 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDH7Q9ULB5 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDH7Q9ULB5 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDH7Q9ULB5 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDH7Q9ULB5 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDH7Q9ULB5 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDH7Q9ULB5 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDH7Q9ULB5 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH7Q9ULB5 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms