Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNNA3Q9UI47 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms