Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms