Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U4

CXXC1, CXXC-type zinc finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXXC1Q9P0U4 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXXC1Q9P0U4 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.9 ms