Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX07

TRNAU1AP, tRNA selenocysteine 1-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNAU1APQ9NX07 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRNAU1APQ9NX07 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
TRNAU1APQ9NX07 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
TRNAU1APQ9NX07 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRNAU1APQ9NX07 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRNAU1APQ9NX07 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRNAU1APQ9NX07 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRNAU1APQ9NX07 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRNAU1APQ9NX07 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRNAU1APQ9NX07 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRNAU1APQ9NX07 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRNAU1APQ9NX07 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRNAU1APQ9NX07 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRNAU1APQ9NX07 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRNAU1APQ9NX07 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRNAU1APQ9NX07 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRNAU1APQ9NX07 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRNAU1APQ9NX07 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRNAU1APQ9NX07 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRNAU1APQ9NX07 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRNAU1APQ9NX07 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRNAU1APQ9NX07 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRNAU1APQ9NX07 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRNAU1APQ9NX07 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRNAU1APQ9NX07 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRNAU1APQ9NX07 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRNAU1APQ9NX07 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRNAU1APQ9NX07 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRNAU1APQ9NX07 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRNAU1APQ9NX07 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRNAU1APQ9NX07 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRNAU1APQ9NX07 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRNAU1APQ9NX07 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRNAU1APQ9NX07 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRNAU1APQ9NX07 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRNAU1APQ9NX07 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRNAU1APQ9NX07 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRNAU1APQ9NX07 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRNAU1APQ9NX07 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRNAU1APQ9NX07 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRNAU1APQ9NX07 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRNAU1APQ9NX07 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRNAU1APQ9NX07 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRNAU1APQ9NX07 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRNAU1APQ9NX07 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRNAU1APQ9NX07 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRNAU1APQ9NX07 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRNAU1APQ9NX07 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRNAU1APQ9NX07 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRNAU1APQ9NX07 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRNAU1APQ9NX07 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRNAU1APQ9NX07 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRNAU1APQ9NX07 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRNAU1APQ9NX07 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRNAU1APQ9NX07 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRNAU1APQ9NX07 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRNAU1APQ9NX07 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRNAU1APQ9NX07 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRNAU1APQ9NX07 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRNAU1APQ9NX07 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRNAU1APQ9NX07 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRNAU1APQ9NX07 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRNAU1APQ9NX07 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRNAU1APQ9NX07 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRNAU1APQ9NX07 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRNAU1APQ9NX07 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRNAU1APQ9NX07 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRNAU1APQ9NX07 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRNAU1APQ9NX07 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRNAU1APQ9NX07 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRNAU1APQ9NX07 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRNAU1APQ9NX07 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRNAU1APQ9NX07 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRNAU1APQ9NX07 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRNAU1APQ9NX07 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRNAU1APQ9NX07 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRNAU1APQ9NX07 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRNAU1APQ9NX07 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRNAU1APQ9NX07 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRNAU1APQ9NX07 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRNAU1APQ9NX07 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRNAU1APQ9NX07 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRNAU1APQ9NX07 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRNAU1APQ9NX07 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRNAU1APQ9NX07 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRNAU1APQ9NX07 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRNAU1APQ9NX07 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRNAU1APQ9NX07 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRNAU1APQ9NX07 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRNAU1APQ9NX07 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRNAU1APQ9NX07 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRNAU1APQ9NX07 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRNAU1APQ9NX07 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRNAU1APQ9NX07 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRNAU1APQ9NX07 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRNAU1APQ9NX07 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRNAU1APQ9NX07 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRNAU1APQ9NX07 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRNAU1APQ9NX07 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRNAU1APQ9NX07 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms