Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV96

TMEM30A, Cell cycle control protein 50A, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30AQ9NV96 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM30AQ9NV96 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms