Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms