Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CENPMQ9NSP4 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CENPMQ9NSP4 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CENPMQ9NSP4 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CENPMQ9NSP4 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CENPMQ9NSP4 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CENPMQ9NSP4 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CENPMQ9NSP4 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CENPMQ9NSP4 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CENPMQ9NSP4 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CENPMQ9NSP4 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CENPMQ9NSP4 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CENPMQ9NSP4 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CENPMQ9NSP4 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CENPMQ9NSP4 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CENPMQ9NSP4 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CENPMQ9NSP4 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CENPMQ9NSP4 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CENPMQ9NSP4 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CENPMQ9NSP4 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CENPMQ9NSP4 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CENPMQ9NSP4 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CENPMQ9NSP4 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CENPMQ9NSP4 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CENPMQ9NSP4 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CENPMQ9NSP4 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CENPMQ9NSP4 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CENPMQ9NSP4 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CENPMQ9NSP4 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CENPMQ9NSP4 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CENPMQ9NSP4 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CENPMQ9NSP4 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CENPMQ9NSP4 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CENPMQ9NSP4 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CENPMQ9NSP4 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CENPMQ9NSP4 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CENPMQ9NSP4 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CENPMQ9NSP4 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CENPMQ9NSP4 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CENPMQ9NSP4 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CENPMQ9NSP4 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CENPMQ9NSP4 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CENPMQ9NSP4 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CENPMQ9NSP4 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CENPMQ9NSP4 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CENPMQ9NSP4 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CENPMQ9NSP4 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CENPMQ9NSP4 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CENPMQ9NSP4 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CENPMQ9NSP4 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CENPMQ9NSP4 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CENPMQ9NSP4 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CENPMQ9NSP4 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CENPMQ9NSP4 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CENPMQ9NSP4 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CENPMQ9NSP4 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CENPMQ9NSP4 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CENPMQ9NSP4 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CENPMQ9NSP4 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CENPMQ9NSP4 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CENPMQ9NSP4 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CENPMQ9NSP4 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CENPMQ9NSP4 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CENPMQ9NSP4 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CENPMQ9NSP4 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CENPMQ9NSP4 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CENPMQ9NSP4 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CENPMQ9NSP4 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CENPMQ9NSP4 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CENPMQ9NSP4 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CENPMQ9NSP4 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CENPMQ9NSP4 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
CENPMQ9NSP4 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
CENPMQ9NSP4 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CENPMQ9NSP4 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CENPMQ9NSP4 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CENPMQ9NSP4 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CENPMQ9NSP4 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CENPMQ9NSP4 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CENPMQ9NSP4 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CENPMQ9NSP4 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CENPMQ9NSP4 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CENPMQ9NSP4 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CENPMQ9NSP4 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CENPMQ9NSP4 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CENPMQ9NSP4 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CENPMQ9NSP4 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CENPMQ9NSP4 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CENPMQ9NSP4 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CENPMQ9NSP4 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CENPMQ9NSP4 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
CENPMQ9NSP4 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CENPMQ9NSP4 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CENPMQ9NSP4 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CENPMQ9NSP4 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CENPMQ9NSP4 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CENPMQ9NSP4 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CENPMQ9NSP4 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CENPMQ9NSP4 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CENPMQ9NSP4 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms