Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE7

ABCC13, Putative ATP-binding cassette sub-family C member 13, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC13Q9NSE7 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ABCC13Q9NSE7 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms