Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SEMA4BQ9NPR2 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4BQ9NPR2 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms