Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM2

PLXNA4, Plexin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA4Q9HCM2 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PLXNA4Q9HCM2 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PLXNA4Q9HCM2 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLXNA4Q9HCM2 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLXNA4Q9HCM2 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLXNA4Q9HCM2 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLXNA4Q9HCM2 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLXNA4Q9HCM2 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLXNA4Q9HCM2 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PLXNA4Q9HCM2 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PLXNA4Q9HCM2 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PLXNA4Q9HCM2 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PLXNA4Q9HCM2 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PLXNA4Q9HCM2 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PLXNA4Q9HCM2 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PLXNA4Q9HCM2 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PLXNA4Q9HCM2 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PLXNA4Q9HCM2 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
PLXNA4Q9HCM2 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PLXNA4Q9HCM2 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PLXNA4Q9HCM2 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PLXNA4Q9HCM2 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PLXNA4Q9HCM2 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PLXNA4Q9HCM2 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PLXNA4Q9HCM2 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PLXNA4Q9HCM2 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PLXNA4Q9HCM2 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PLXNA4Q9HCM2 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PLXNA4Q9HCM2 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PLXNA4Q9HCM2 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PLXNA4Q9HCM2 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PLXNA4Q9HCM2 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PLXNA4Q9HCM2 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PLXNA4Q9HCM2 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PLXNA4Q9HCM2 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PLXNA4Q9HCM2 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PLXNA4Q9HCM2 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PLXNA4Q9HCM2 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PLXNA4Q9HCM2 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PLXNA4Q9HCM2 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PLXNA4Q9HCM2 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PLXNA4Q9HCM2 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PLXNA4Q9HCM2 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PLXNA4Q9HCM2 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PLXNA4Q9HCM2 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PLXNA4Q9HCM2 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PLXNA4Q9HCM2 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PLXNA4Q9HCM2 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PLXNA4Q9HCM2 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLXNA4Q9HCM2 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLXNA4Q9HCM2 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLXNA4Q9HCM2 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PLXNA4Q9HCM2 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLXNA4Q9HCM2 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLXNA4Q9HCM2 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLXNA4Q9HCM2 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLXNA4Q9HCM2 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLXNA4Q9HCM2 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLXNA4Q9HCM2 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLXNA4Q9HCM2 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLXNA4Q9HCM2 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLXNA4Q9HCM2 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLXNA4Q9HCM2 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLXNA4Q9HCM2 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLXNA4Q9HCM2 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLXNA4Q9HCM2 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PLXNA4Q9HCM2 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLXNA4Q9HCM2 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLXNA4Q9HCM2 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLXNA4Q9HCM2 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLXNA4Q9HCM2 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLXNA4Q9HCM2 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLXNA4Q9HCM2 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLXNA4Q9HCM2 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLXNA4Q9HCM2 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLXNA4Q9HCM2 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLXNA4Q9HCM2 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLXNA4Q9HCM2 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PLXNA4Q9HCM2 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PLXNA4Q9HCM2 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLXNA4Q9HCM2 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLXNA4Q9HCM2 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PLXNA4Q9HCM2 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PLXNA4Q9HCM2 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLXNA4Q9HCM2 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PLXNA4Q9HCM2 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLXNA4Q9HCM2 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLXNA4Q9HCM2 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLXNA4Q9HCM2 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLXNA4Q9HCM2 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLXNA4Q9HCM2 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLXNA4Q9HCM2 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLXNA4Q9HCM2 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLXNA4Q9HCM2 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLXNA4Q9HCM2 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLXNA4Q9HCM2 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLXNA4Q9HCM2 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLXNA4Q9HCM2 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLXNA4Q9HCM2 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLXNA4Q9HCM2 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms