Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
USP29Q9HBJ7 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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