Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms