Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GSDMCQ9BYG8 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms