Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 HYOU1-221ENST00000621959 3358 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 TBC1D29-202ENST00000580161 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 UNC13D-201ENST00000207549 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 ZDHHC11-201ENST00000283441 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 AL021155.1-201ENST00000438808 2637 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 LINC01024-201ENST00000499203 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 DENND1C-201ENST00000381480 2816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 OR52A1-202ENST00000380367 9783 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 CPLX4-202ENST00000587244 1916 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 PCDHB2-201ENST00000194155 4126 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 C17orf53-202ENST00000319977 2725 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 GAS7-219ENST00000585266 3535 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 AL355388.2-201ENST00000610146 2157 ntTSL 4 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 LENG8-201ENST00000326764 3991 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 TOLLIP-207ENST00000527886 3666 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 RIC8B-201ENST00000355478 3207 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 HK3-201ENST00000292432 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 ATXN2L-205ENST00000395547 3981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 SYNRG-229ENST00000621136 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 SPAG5-AS1-201ENST00000414744 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 FLT4-212ENST00000619105 3806 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 CICP7-201ENST00000432723 2477 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 GUCY2D-201ENST00000254854 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 LGR6-203ENST00000367278 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 FBF1-210ENST00000592193 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms