Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
KATNB1Q9BVA0 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KATNB1Q9BVA0 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
KATNB1Q9BVA0 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KATNB1Q9BVA0 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
KATNB1Q9BVA0 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KATNB1Q9BVA0 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
KATNB1Q9BVA0 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
KATNB1Q9BVA0 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
KATNB1Q9BVA0 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
KATNB1Q9BVA0 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KATNB1Q9BVA0 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KATNB1Q9BVA0 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KATNB1Q9BVA0 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
KATNB1Q9BVA0 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KATNB1Q9BVA0 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KATNB1Q9BVA0 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
KATNB1Q9BVA0 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
KATNB1Q9BVA0 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
KATNB1Q9BVA0 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
KATNB1Q9BVA0 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
KATNB1Q9BVA0 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KATNB1Q9BVA0 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
KATNB1Q9BVA0 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
KATNB1Q9BVA0 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
KATNB1Q9BVA0 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KATNB1Q9BVA0 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KATNB1Q9BVA0 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KATNB1Q9BVA0 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KATNB1Q9BVA0 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
KATNB1Q9BVA0 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
KATNB1Q9BVA0 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KATNB1Q9BVA0 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KATNB1Q9BVA0 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
KATNB1Q9BVA0 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KATNB1Q9BVA0 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
KATNB1Q9BVA0 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KATNB1Q9BVA0 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KATNB1Q9BVA0 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
KATNB1Q9BVA0 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
KATNB1Q9BVA0 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KATNB1Q9BVA0 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
KATNB1Q9BVA0 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KATNB1Q9BVA0 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
KATNB1Q9BVA0 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KATNB1Q9BVA0 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KATNB1Q9BVA0 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KATNB1Q9BVA0 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KATNB1Q9BVA0 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KATNB1Q9BVA0 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KATNB1Q9BVA0 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KATNB1Q9BVA0 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KATNB1Q9BVA0 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KATNB1Q9BVA0 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KATNB1Q9BVA0 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KATNB1Q9BVA0 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KATNB1Q9BVA0 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KATNB1Q9BVA0 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KATNB1Q9BVA0 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KATNB1Q9BVA0 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KATNB1Q9BVA0 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KATNB1Q9BVA0 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KATNB1Q9BVA0 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KATNB1Q9BVA0 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KATNB1Q9BVA0 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KATNB1Q9BVA0 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
KATNB1Q9BVA0 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KATNB1Q9BVA0 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KATNB1Q9BVA0 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KATNB1Q9BVA0 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KATNB1Q9BVA0 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KATNB1Q9BVA0 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
KATNB1Q9BVA0 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KATNB1Q9BVA0 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KATNB1Q9BVA0 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
KATNB1Q9BVA0 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
KATNB1Q9BVA0 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
KATNB1Q9BVA0 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
KATNB1Q9BVA0 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
KATNB1Q9BVA0 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
KATNB1Q9BVA0 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
KATNB1Q9BVA0 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
KATNB1Q9BVA0 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
KATNB1Q9BVA0 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
KATNB1Q9BVA0 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
KATNB1Q9BVA0 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
KATNB1Q9BVA0 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
KATNB1Q9BVA0 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
KATNB1Q9BVA0 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
KATNB1Q9BVA0 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
KATNB1Q9BVA0 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
KATNB1Q9BVA0 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
KATNB1Q9BVA0 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
KATNB1Q9BVA0 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
KATNB1Q9BVA0 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
KATNB1Q9BVA0 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
KATNB1Q9BVA0 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
KATNB1Q9BVA0 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
KATNB1Q9BVA0 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
KATNB1Q9BVA0 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms