Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms