Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH5

HDHD3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDHD3Q9BSH5 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HDHD3Q9BSH5 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HDHD3Q9BSH5 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HDHD3Q9BSH5 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HDHD3Q9BSH5 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HDHD3Q9BSH5 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HDHD3Q9BSH5 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HDHD3Q9BSH5 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HDHD3Q9BSH5 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HDHD3Q9BSH5 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HDHD3Q9BSH5 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HDHD3Q9BSH5 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HDHD3Q9BSH5 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HDHD3Q9BSH5 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HDHD3Q9BSH5 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HDHD3Q9BSH5 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HDHD3Q9BSH5 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HDHD3Q9BSH5 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HDHD3Q9BSH5 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HDHD3Q9BSH5 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HDHD3Q9BSH5 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HDHD3Q9BSH5 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HDHD3Q9BSH5 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HDHD3Q9BSH5 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HDHD3Q9BSH5 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HDHD3Q9BSH5 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HDHD3Q9BSH5 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HDHD3Q9BSH5 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HDHD3Q9BSH5 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HDHD3Q9BSH5 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HDHD3Q9BSH5 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HDHD3Q9BSH5 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HDHD3Q9BSH5 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HDHD3Q9BSH5 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HDHD3Q9BSH5 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HDHD3Q9BSH5 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HDHD3Q9BSH5 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HDHD3Q9BSH5 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HDHD3Q9BSH5 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HDHD3Q9BSH5 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HDHD3Q9BSH5 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HDHD3Q9BSH5 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HDHD3Q9BSH5 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HDHD3Q9BSH5 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HDHD3Q9BSH5 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HDHD3Q9BSH5 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HDHD3Q9BSH5 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HDHD3Q9BSH5 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HDHD3Q9BSH5 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HDHD3Q9BSH5 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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HDHD3Q9BSH5 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HDHD3Q9BSH5 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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HDHD3Q9BSH5 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HDHD3Q9BSH5 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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HDHD3Q9BSH5 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HDHD3Q9BSH5 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HDHD3Q9BSH5 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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HDHD3Q9BSH5 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HDHD3Q9BSH5 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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HDHD3Q9BSH5 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HDHD3Q9BSH5 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HDHD3Q9BSH5 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HDHD3Q9BSH5 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HDHD3Q9BSH5 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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HDHD3Q9BSH5 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HDHD3Q9BSH5 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HDHD3Q9BSH5 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HDHD3Q9BSH5 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HDHD3Q9BSH5 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HDHD3Q9BSH5 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HDHD3Q9BSH5 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HDHD3Q9BSH5 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HDHD3Q9BSH5 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HDHD3Q9BSH5 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HDHD3Q9BSH5 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HDHD3Q9BSH5 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HDHD3Q9BSH5 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HDHD3Q9BSH5 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HDHD3Q9BSH5 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HDHD3Q9BSH5 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HDHD3Q9BSH5 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HDHD3Q9BSH5 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HDHD3Q9BSH5 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HDHD3Q9BSH5 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HDHD3Q9BSH5 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HDHD3Q9BSH5 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HDHD3Q9BSH5 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HDHD3Q9BSH5 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HDHD3Q9BSH5 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HDHD3Q9BSH5 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HDHD3Q9BSH5 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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