Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM79Q9BSE2 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms