Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ3

GORASP1, Golgi reassembly-stacking protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GORASP1Q9BQQ3 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GORASP1Q9BQQ3 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms