Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 ZCCHC6-203ENST00000375948 958 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 SNX11-210ENST00000582104 1282 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 AC012370.2-204ENST00000601940 1320 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 AC004895.1-203ENST00000428901 540 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 SMAD9-IT1-201ENST00000437983 504 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 AC004672.2-201ENST00000537181 574 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms