Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ95

ECSIT, Evolutionarily conserved signaling intermediate in Toll pathway, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECSITQ9BQ95 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ECSITQ9BQ95 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ECSITQ9BQ95 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ECSITQ9BQ95 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ECSITQ9BQ95 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ECSITQ9BQ95 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
ECSITQ9BQ95 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ECSITQ9BQ95 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ECSITQ9BQ95 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ECSITQ9BQ95 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ECSITQ9BQ95 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ECSITQ9BQ95 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ECSITQ9BQ95 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ECSITQ9BQ95 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ECSITQ9BQ95 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ECSITQ9BQ95 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ECSITQ9BQ95 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ECSITQ9BQ95 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ECSITQ9BQ95 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ECSITQ9BQ95 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ECSITQ9BQ95 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ECSITQ9BQ95 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ECSITQ9BQ95 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ECSITQ9BQ95 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ECSITQ9BQ95 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ECSITQ9BQ95 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
ECSITQ9BQ95 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ECSITQ9BQ95 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ECSITQ9BQ95 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ECSITQ9BQ95 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ECSITQ9BQ95 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ECSITQ9BQ95 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ECSITQ9BQ95 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ECSITQ9BQ95 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
ECSITQ9BQ95 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ECSITQ9BQ95 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ECSITQ9BQ95 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ECSITQ9BQ95 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ECSITQ9BQ95 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ECSITQ9BQ95 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ECSITQ9BQ95 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ECSITQ9BQ95 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ECSITQ9BQ95 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ECSITQ9BQ95 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ECSITQ9BQ95 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ECSITQ9BQ95 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ECSITQ9BQ95 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
ECSITQ9BQ95 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ECSITQ9BQ95 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ECSITQ9BQ95 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ECSITQ9BQ95 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ECSITQ9BQ95 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ECSITQ9BQ95 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ECSITQ9BQ95 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ECSITQ9BQ95 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ECSITQ9BQ95 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ECSITQ9BQ95 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ECSITQ9BQ95 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ECSITQ9BQ95 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ECSITQ9BQ95 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ECSITQ9BQ95 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ECSITQ9BQ95 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ECSITQ9BQ95 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ECSITQ9BQ95 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ECSITQ9BQ95 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ECSITQ9BQ95 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ECSITQ9BQ95 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ECSITQ9BQ95 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ECSITQ9BQ95 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ECSITQ9BQ95 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ECSITQ9BQ95 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ECSITQ9BQ95 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ECSITQ9BQ95 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ECSITQ9BQ95 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ECSITQ9BQ95 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ECSITQ9BQ95 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ECSITQ9BQ95 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ECSITQ9BQ95 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ECSITQ9BQ95 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ECSITQ9BQ95 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ECSITQ9BQ95 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ECSITQ9BQ95 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ECSITQ9BQ95 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ECSITQ9BQ95 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ECSITQ9BQ95 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
ECSITQ9BQ95 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
ECSITQ9BQ95 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ECSITQ9BQ95 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ECSITQ9BQ95 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ECSITQ9BQ95 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ECSITQ9BQ95 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ECSITQ9BQ95 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ECSITQ9BQ95 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ECSITQ9BQ95 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ECSITQ9BQ95 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ECSITQ9BQ95 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ECSITQ9BQ95 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ECSITQ9BQ95 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ECSITQ9BQ95 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ECSITQ9BQ95 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms