Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC8.82□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 KCNAB2-202ENST00000341524 4207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 MKL1-211ENST00000618196 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 SLC36A1-201ENST00000243389 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 HECW2-202ENST00000409111 6692 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 ZNF646-201ENST00000300850 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 PDE7B-201ENST00000308191 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 IP6K1-202ENST00000395238 4117 ntTSL 3 BASIC8.81□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 NAP1L1-201ENST00000261182 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC8.81□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC8.81□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC8.81□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC8.81□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC8.81□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC8.81□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC8.81□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 JADE1-209ENST00000511647 3560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 PPP4R3B-203ENST00000611717 5243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 AP002008.2-201ENST00000635926 4870 ntBASIC8.81□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 POLR1B-216ENST00000537335 4961 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 BAIAP3-203ENST00000421665 3875 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 FAM237B-201ENST00000637645 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 GRIP2-205ENST00000621039 7752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 KCNMA1-227ENST00000638203 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 FAM225B-201ENST00000423546 5629 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 KCNS2-202ENST00000521839 4340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 NRXN1-259ENST00000637511 3651 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 GPR179-203ENST00000616987 7980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 SPCS3-201ENST00000503362 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 LINC01973-201ENST00000374983 4678 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
LINC00208Q96KT6 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms