Protein–RNA interactions for Protein: Q96C45

ULK4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK4Q96C45 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ULK4Q96C45 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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