Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms