Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDKL3Q8IVW4 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms