Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms