Protein–RNA interactions for Protein: Q712K3

UBE2R2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2R2Q712K3 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2R2Q712K3 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms