Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL2

USP45, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 45, humanhuman

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Length 814 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP45Q70EL2 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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USP45Q70EL2 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP45Q70EL2 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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