Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM72Q6ZMU5 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms