Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LRRC8EQ6NSJ5 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms