Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms