Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUD6

FAM69B, Protein FAM69B, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM69BQ5VUD6 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM69BQ5VUD6 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM69BQ5VUD6 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM69BQ5VUD6 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM69BQ5VUD6 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM69BQ5VUD6 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM69BQ5VUD6 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM69BQ5VUD6 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM69BQ5VUD6 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM69BQ5VUD6 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM69BQ5VUD6 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM69BQ5VUD6 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM69BQ5VUD6 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM69BQ5VUD6 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM69BQ5VUD6 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM69BQ5VUD6 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM69BQ5VUD6 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM69BQ5VUD6 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM69BQ5VUD6 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM69BQ5VUD6 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM69BQ5VUD6 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM69BQ5VUD6 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM69BQ5VUD6 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM69BQ5VUD6 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM69BQ5VUD6 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM69BQ5VUD6 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM69BQ5VUD6 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM69BQ5VUD6 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM69BQ5VUD6 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM69BQ5VUD6 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM69BQ5VUD6 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM69BQ5VUD6 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM69BQ5VUD6 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM69BQ5VUD6 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM69BQ5VUD6 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM69BQ5VUD6 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM69BQ5VUD6 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM69BQ5VUD6 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM69BQ5VUD6 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM69BQ5VUD6 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM69BQ5VUD6 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM69BQ5VUD6 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM69BQ5VUD6 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM69BQ5VUD6 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM69BQ5VUD6 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM69BQ5VUD6 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM69BQ5VUD6 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM69BQ5VUD6 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM69BQ5VUD6 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM69BQ5VUD6 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM69BQ5VUD6 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM69BQ5VUD6 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM69BQ5VUD6 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM69BQ5VUD6 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM69BQ5VUD6 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM69BQ5VUD6 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM69BQ5VUD6 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM69BQ5VUD6 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM69BQ5VUD6 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM69BQ5VUD6 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM69BQ5VUD6 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM69BQ5VUD6 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM69BQ5VUD6 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM69BQ5VUD6 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM69BQ5VUD6 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM69BQ5VUD6 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM69BQ5VUD6 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM69BQ5VUD6 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM69BQ5VUD6 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM69BQ5VUD6 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM69BQ5VUD6 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM69BQ5VUD6 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM69BQ5VUD6 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM69BQ5VUD6 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM69BQ5VUD6 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM69BQ5VUD6 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM69BQ5VUD6 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM69BQ5VUD6 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM69BQ5VUD6 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM69BQ5VUD6 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM69BQ5VUD6 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM69BQ5VUD6 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM69BQ5VUD6 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM69BQ5VUD6 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM69BQ5VUD6 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FAM69BQ5VUD6 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM69BQ5VUD6 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM69BQ5VUD6 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM69BQ5VUD6 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM69BQ5VUD6 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM69BQ5VUD6 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM69BQ5VUD6 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FAM69BQ5VUD6 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM69BQ5VUD6 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM69BQ5VUD6 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM69BQ5VUD6 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM69BQ5VUD6 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM69BQ5VUD6 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM69BQ5VUD6 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FAM69BQ5VUD6 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms