Protein–RNA interactions for Protein: Q3B8N5

PROX2, Prospero homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX2Q3B8N5 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 SETP12-201ENST00000514068 805 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PROX2Q3B8N5 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms