Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPB7

AP5B1, AP-5 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5B1Q2VPB7 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP5B1Q2VPB7 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP5B1Q2VPB7 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP5B1Q2VPB7 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP5B1Q2VPB7 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
AP5B1Q2VPB7 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP5B1Q2VPB7 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP5B1Q2VPB7 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP5B1Q2VPB7 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP5B1Q2VPB7 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP5B1Q2VPB7 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AP5B1Q2VPB7 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AP5B1Q2VPB7 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AP5B1Q2VPB7 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
AP5B1Q2VPB7 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
AP5B1Q2VPB7 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
AP5B1Q2VPB7 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AP5B1Q2VPB7 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
AP5B1Q2VPB7 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
AP5B1Q2VPB7 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AP5B1Q2VPB7 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AP5B1Q2VPB7 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AP5B1Q2VPB7 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AP5B1Q2VPB7 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AP5B1Q2VPB7 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP5B1Q2VPB7 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.08■□□□□ 0
AP5B1Q2VPB7 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
AP5B1Q2VPB7 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP5B1Q2VPB7 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
AP5B1Q2VPB7 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
AP5B1Q2VPB7 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP5B1Q2VPB7 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP5B1Q2VPB7 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP5B1Q2VPB7 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
AP5B1Q2VPB7 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
AP5B1Q2VPB7 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
AP5B1Q2VPB7 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
AP5B1Q2VPB7 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP5B1Q2VPB7 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
AP5B1Q2VPB7 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
AP5B1Q2VPB7 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP5B1Q2VPB7 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
AP5B1Q2VPB7 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
AP5B1Q2VPB7 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
AP5B1Q2VPB7 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP5B1Q2VPB7 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP5B1Q2VPB7 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP5B1Q2VPB7 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP5B1Q2VPB7 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP5B1Q2VPB7 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP5B1Q2VPB7 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP5B1Q2VPB7 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AP5B1Q2VPB7 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AP5B1Q2VPB7 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP5B1Q2VPB7 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP5B1Q2VPB7 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AP5B1Q2VPB7 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
AP5B1Q2VPB7 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP5B1Q2VPB7 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP5B1Q2VPB7 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP5B1Q2VPB7 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP5B1Q2VPB7 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP5B1Q2VPB7 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP5B1Q2VPB7 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AP5B1Q2VPB7 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AP5B1Q2VPB7 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AP5B1Q2VPB7 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AP5B1Q2VPB7 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AP5B1Q2VPB7 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AP5B1Q2VPB7 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AP5B1Q2VPB7 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AP5B1Q2VPB7 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AP5B1Q2VPB7 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AP5B1Q2VPB7 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AP5B1Q2VPB7 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AP5B1Q2VPB7 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AP5B1Q2VPB7 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AP5B1Q2VPB7 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AP5B1Q2VPB7 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AP5B1Q2VPB7 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
AP5B1Q2VPB7 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AP5B1Q2VPB7 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AP5B1Q2VPB7 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AP5B1Q2VPB7 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.07■□□□□ 0
AP5B1Q2VPB7 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.07■□□□□ 0
AP5B1Q2VPB7 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AP5B1Q2VPB7 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AP5B1Q2VPB7 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AP5B1Q2VPB7 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AP5B1Q2VPB7 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
AP5B1Q2VPB7 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AP5B1Q2VPB7 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
AP5B1Q2VPB7 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
AP5B1Q2VPB7 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.07■□□□□ 0
AP5B1Q2VPB7 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.07■□□□□ 0
AP5B1Q2VPB7 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.07■□□□□ 0
AP5B1Q2VPB7 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AP5B1Q2VPB7 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AP5B1Q2VPB7 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AP5B1Q2VPB7 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms