Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KNOP1Q1ED39 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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KNOP1Q1ED39 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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KNOP1Q1ED39 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KNOP1Q1ED39 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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