Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms