Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms