Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNA6Q15825 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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