Protein–RNA interactions for Protein: Q15648

MED1, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED1Q15648 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.9
MED1Q15648 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
MED1Q15648 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.9
MED1Q15648 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
MED1Q15648 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MED1Q15648 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MED1Q15648 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MED1Q15648 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MED1Q15648 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MED1Q15648 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MED1Q15648 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MED1Q15648 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MED1Q15648 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MED1Q15648 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MED1Q15648 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MED1Q15648 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MED1Q15648 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MED1Q15648 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MED1Q15648 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MED1Q15648 PPP1R7-205ENST00000404405 1009 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MED1Q15648 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
MED1Q15648 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
MED1Q15648 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MED1Q15648 GLUD1P3-201ENST00000507952 896 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MED1Q15648 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MED1Q15648 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
MED1Q15648 AC009093.2-201ENST00000563477 546 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MED1Q15648 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MED1Q15648 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MED1Q15648 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MED1Q15648 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MED1Q15648 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MED1Q15648 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MED1Q15648 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MED1Q15648 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MED1Q15648 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MED1Q15648 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MED1Q15648 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MED1Q15648 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MED1Q15648 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MED1Q15648 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MED1Q15648 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MED1Q15648 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MED1Q15648 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MED1Q15648 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MED1Q15648 OLA1P2-201ENST00000395519 1264 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
MED1Q15648 MACROD2-204ENST00000407045 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MED1Q15648 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MED1Q15648 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MED1Q15648 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MED1Q15648 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
MED1Q15648 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MED1Q15648 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MED1Q15648 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MED1Q15648 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
MED1Q15648 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MED1Q15648 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MED1Q15648 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MED1Q15648 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MED1Q15648 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MED1Q15648 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MED1Q15648 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MED1Q15648 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MED1Q15648 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MED1Q15648 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MED1Q15648 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED1Q15648 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED1Q15648 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED1Q15648 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED1Q15648 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED1Q15648 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED1Q15648 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED1Q15648 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED1Q15648 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED1Q15648 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED1Q15648 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
MED1Q15648 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED1Q15648 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED1Q15648 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED1Q15648 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED1Q15648 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED1Q15648 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED1Q15648 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED1Q15648 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED1Q15648 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED1Q15648 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
MED1Q15648 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED1Q15648 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED1Q15648 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED1Q15648 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
MED1Q15648 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED1Q15648 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED1Q15648 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED1Q15648 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED1Q15648 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED1Q15648 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED1Q15648 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED1Q15648 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED1Q15648 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED1Q15648 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms