Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TAF11Q15544 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms