Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SS18Q15532 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SS18Q15532 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SS18Q15532 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SS18Q15532 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SS18Q15532 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SS18Q15532 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SS18Q15532 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SS18Q15532 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SS18Q15532 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SS18Q15532 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SS18Q15532 MYO7A-202ENST00000409709 7462 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SS18Q15532 RFFL-201ENST00000315249 7293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SS18Q15532 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SS18Q15532 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SS18Q15532 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SS18Q15532 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SS18Q15532 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SS18Q15532 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SS18Q15532 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SS18Q15532 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SS18Q15532 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SS18Q15532 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SS18Q15532 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SS18Q15532 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SS18Q15532 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SS18Q15532 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SS18Q15532 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SS18Q15532 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SS18Q15532 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SS18Q15532 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SS18Q15532 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SS18Q15532 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SS18Q15532 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SS18Q15532 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SS18Q15532 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SS18Q15532 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SS18Q15532 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SS18Q15532 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SS18Q15532 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SS18Q15532 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SS18Q15532 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SS18Q15532 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SS18Q15532 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SS18Q15532 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SS18Q15532 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SS18Q15532 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SS18Q15532 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SS18Q15532 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SS18Q15532 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SS18Q15532 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SS18Q15532 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SS18Q15532 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SS18Q15532 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SS18Q15532 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SS18Q15532 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SS18Q15532 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SS18Q15532 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SS18Q15532 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SS18Q15532 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SS18Q15532 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SS18Q15532 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SS18Q15532 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SS18Q15532 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SS18Q15532 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SS18Q15532 OR2I1P-208ENST00000641137 4948 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SS18Q15532 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SS18Q15532 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SS18Q15532 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SS18Q15532 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SS18Q15532 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SS18Q15532 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SS18Q15532 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SS18Q15532 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SS18Q15532 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SS18Q15532 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SS18Q15532 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SS18Q15532 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SS18Q15532 PRPF38A-201ENST00000257181 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SS18Q15532 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SS18Q15532 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SS18Q15532 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SS18Q15532 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SS18Q15532 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SS18Q15532 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SS18Q15532 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SS18Q15532 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SS18Q15532 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SS18Q15532 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SS18Q15532 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SS18Q15532 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SS18Q15532 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SS18Q15532 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SS18Q15532 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SS18Q15532 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SS18Q15532 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SS18Q15532 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SS18Q15532 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SS18Q15532 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SS18Q15532 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms