Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TLR1Q15399 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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