Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 AC087620.1-201ENST00000520037 447 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 Z95624.1-201ENST00000413528 628 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 ZNF175-204ENST00000596504 580 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC19■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC19■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
R3HDM1Q15032 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC19■□□□□ 0.63
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