Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
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