Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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SCARF1Q14162 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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SCARF1Q14162 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
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SCARF1Q14162 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCARF1Q14162 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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