Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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CKAP5Q14008 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
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CKAP5Q14008 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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CKAP5Q14008 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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CKAP5Q14008 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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CKAP5Q14008 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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CKAP5Q14008 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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CKAP5Q14008 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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CKAP5Q14008 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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CKAP5Q14008 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
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CKAP5Q14008 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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